马上注册,结交更多好友,享用更多功能,让你轻松玩转社区。
您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?立即注册
x
本帖最后由 青菜567 于 2023-9-28 10:41 编辑 ) ^6 h7 ~0 G; g) i
5 ~. L7 V, |3 e/ r0 q
无论就医看病还是体检,做的检查除了仪器检查如B超、CT、核磁共振、胃肠镜外,最多的就是生化检查,如基于血液、尿液、大便、痰液等的检测,因为这些体液中含有众多生物标志物,能够提供关于健康状况和疾病风险的重要信息。- F' D6 f" t3 e& m" ]/ P
, f- D6 P- J1 y. v
以血液为例,血液是流动在人的血管和心脏中的一种红色不透明的粘稠液体,负责各类营养物质的输送以及机体产生的废物的排除。血液由血浆和血细胞组成。血浆中含有水、蛋白质和其他溶解物质,血细胞包括红细胞、白细胞和血小板。 6 u! M& e2 a2 e& u9 b! E
血液中一些指标的异常时常预示着身体某个器官或组织机能受损。目前基于血液的肿瘤早筛技术中经常提到的cfDNA就是血浆中存在的一种分子标志物。 4 D0 O0 B, J1 c: w- {" H
(参考于网络图片)
4 ?( Z0 |3 g" m4 Y; M7 d) m
, Z9 r' a B9 B1 B6 `, j g如何理解cfDNA和ctDNA? , i4 O& e$ P0 M7 _
cfDNA全称为cell free DNA即细胞游离DNA,顾名思义就是指游离于细胞外的DNA。那么问题来了,DNA不都是在细胞内吗,怎么会跑到细胞外呢?
: k+ a7 S, A1 R6 }. K; @, o; ~
人体内的细胞不断更新换代,也就是说每天每时每刻我们体内都不断地有细胞在凋亡,又有新的细胞在形成。在细胞凋亡过程中有些DNA会“破壳而出”进入血液中,另外,人体在外界物理或化学刺激下引发的细胞坏死也会导致DNA释放到血液中,所以我们人体血液中都含有cfDNA。
3 Z/ V: u9 u- p% U6 M1 f/ A0 P
(参考于网络图片)
8 S2 a4 y% @+ `) z: S/ w但对于肿瘤患者来说,其血液中除了含有正常细胞凋亡或坏死释放的DNA外,还包括肿瘤细胞释放的DNA,这部分DNA有个专有名称叫ctDNA,全称为circulating tumor DNA即循环肿瘤DNA。因此对于肿瘤患者来说,血液中的cfDNA包含了ctDNA。 * m' L# L& H. Q4 ^* _' o
ctDNA主要来源于坏死的肿瘤细胞、凋亡的肿瘤细胞、循环肿瘤细胞(CTC)、肿瘤细胞分泌的外排体,其携带与肿瘤发生相关的分子信号,这些分子信号如同肿瘤的“身份指纹”,对肿瘤早筛、肿瘤精准治疗都具有非常重要的意义。
% h$ l: ^4 r0 u! ^1 |cfDNA全基因组测序肿瘤早筛技术 3 H) y- f& l# N9 `# V, ~0 t ]
通过上面我们了解了cfDNA和ctDNA的概念和区别,那么对于肿瘤早筛来说,到底检测的是cfDNA上的哪些信息?也就是哪些信息是与肿瘤的早期发生相关呢?这个需要经过临床研究进行标志物的筛选和验证。
9 i; o, L `# N1 x1 z3 G/ e
和瑞基因研发团队通过临床研究发现,仅需受检者10ml静脉血,通过全基因组测序技术(WGS, Whole Genome Sequencing)和自主研发的机器学习算法,在全基因组范围内分析四个维度的特征提取及模型构建,包括末端序列、片段大小分布、核小体印迹、拷贝数变异,可精准评估六大高发高危癌种风险,包括肺癌及五大消化系统癌种(食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、结直肠癌),并可准确溯源癌症风险器官。
8 ?! N) S, i% {; W, R
那么如何理解四个维度呢?
$ I) J- i' `( ]4 R1 \6 d; S) M片段大小0 I! r( ?7 w8 J8 ?" c4 ~. a
, r& v) ]- ?: @& tDNA片段大小以核苷酸碱基对的数量表示,以bp为单位。肿瘤细胞释放的ctDNA片段大小比正常细胞释放的cfDNA更短。 & ~( y7 j6 p' k) k5 x+ Y- e; C3 z
末端序列! G( r5 N# Y9 J/ R6 f2 F. N
在DNA片段化进入血液过程中,DNA发生了非随机断裂,其末端的几个核苷酸,癌与非癌具有不同偏好的末端切割模式。
2 A. e' c; z) A a + s! F, `6 G% I. ^, l, m# G& g
核小体印迹
/ }4 c3 ~* Y& g @ |/ d7 [4 N6 ?- f
肿瘤发生和发展的内因是原癌基因的活化和/或抑癌基因的失活等异常表达,而核小体印迹的松散程度可代表基因表达活跃程度的高低。 $ p$ r" v/ Z+ \* G# `
拷贝数变异8 q8 s5 e7 i; A$ t' i# G
% Q3 L# M9 f H4 {6 K% Z4 ]
肿瘤组织通常存在拷贝数变异等染色体异常现象,而正常组织基本无此现象。
& g8 L* y1 N7 R( B" @- Q. B
(可点击图片放大查看) - $ f8 E* T" S! r8 V' s9 u/ a
" o1 R: O7 ]7 t7 s0 c1 {
5 _! H. V5 j" Q. M$ f0 R' O |